MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 plasmid pTGRD2 DNA

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020421	A	6	6	32	37	100 %	0 %	0 %	0 %	189485776
2	NC_020421	AT	3	6	86	91	50 %	50 %	0 %	0 %	189485776
3	NC_020421	TTG	2	6	209	214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485776
4	NC_020421	A	7	7	274	280	100 %	0 %	0 %	0 %	189485776
5	NC_020421	TAA	2	6	396	401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485776
6	NC_020421	CTT	2	6	422	427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189485776
7	NC_020421	T	6	6	448	453	0 %	100 %	0 %	0 %	189485776
8	NC_020421	A	7	7	475	481	100 %	0 %	0 %	0 %	189485776
9	NC_020421	GTT	2	6	517	522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485776
10	NC_020421	TA	3	6	527	532	50 %	50 %	0 %	0 %	189485776
11	NC_020421	ACGC	2	8	589	596	25 %	0 %	25 %	50 %	189485776
12	NC_020421	T	6	6	604	609	0 %	100 %	0 %	0 %	189485776
13	NC_020421	ATT	2	6	613	618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485776
14	NC_020421	AT	3	6	620	625	50 %	50 %	0 %	0 %	189485776
15	NC_020421	ATA	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485776
16	NC_020421	GTT	2	6	673	678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485776
17	NC_020421	ATT	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485776
18	NC_020421	GACG	2	8	796	803	25 %	0 %	50 %	25 %	189485776
19	NC_020421	TACTTT	2	12	813	824	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189485776
20	NC_020421	T	6	6	822	827	0 %	100 %	0 %	0 %	189485776
21	NC_020421	TCA	2	6	852	857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485776
22	NC_020421	GAAA	2	8	922	929	75 %	0 %	25 %	0 %	189485776
23	NC_020421	TGTTA	2	10	989	998	20 %	60 %	20 %	0 %	189485776
24	NC_020421	AGT	2	6	1008	1013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485776
25	NC_020421	TAA	2	6	1020	1025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485776
26	NC_020421	AT	4	8	1037	1044	50 %	50 %	0 %	0 %	189485776
27	NC_020421	AT	3	6	1070	1075	50 %	50 %	0 %	0 %	189485776
28	NC_020421	TGTA	2	8	1157	1164	25 %	50 %	25 %	0 %	189485776
29	NC_020421	ACA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485776
30	NC_020421	TTA	2	6	1243	1248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485776
31	NC_020421	A	8	8	2649	2656	100 %	0 %	0 %	0 %	189485777
32	NC_020421	A	6	6	2665	2670	100 %	0 %	0 %	0 %	189485777
33	NC_020421	ATA	2	6	2798	2803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
34	NC_020421	AAT	2	6	2808	2813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
35	NC_020421	AGAA	2	8	2822	2829	75 %	0 %	25 %	0 %	189485777
36	NC_020421	A	8	8	2844	2851	100 %	0 %	0 %	0 %	189485777
37	NC_020421	AAT	2	6	2857	2862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
38	NC_020421	ATA	2	6	2894	2899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
39	NC_020421	ATA	2	6	2960	2965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
40	NC_020421	TAG	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485777
41	NC_020421	AGCGA	2	10	2995	3004	40 %	0 %	40 %	20 %	189485777
42	NC_020421	CAAGTT	2	12	3172	3183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
43	NC_020421	CAG	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
44	NC_020421	CAAGTT	2	12	3208	3219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
45	NC_020421	CAG	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
46	NC_020421	TCAAGT	2	12	3243	3254	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
47	NC_020421	CAG	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
48	NC_020421	TCAAGT	2	12	3279	3290	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
49	NC_020421	CAG	2	6	3293	3298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
50	NC_020421	TCAAGT	2	12	3315	3326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
51	NC_020421	CAG	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
52	NC_020421	TCAAGT	2	12	3351	3362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
53	NC_020421	CAG	2	6	3365	3370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
54	NC_020421	CAAGTT	2	12	3388	3399	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
55	NC_020421	CAG	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
56	NC_020421	TCAAGT	2	12	3423	3434	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
57	NC_020421	CAG	2	6	3437	3442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
58	NC_020421	CAAGTT	2	12	3460	3471	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
59	NC_020421	CAG	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
60	NC_020421	AT	3	6	3531	3536	50 %	50 %	0 %	0 %	189485777
61	NC_020421	AT	3	6	3588	3593	50 %	50 %	0 %	0 %	189485777
62	NC_020421	TAG	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485777
63	NC_020421	CTA	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485777
64	NC_020421	TCAAGT	2	12	3699	3710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	189485777
65	NC_020421	CAG	2	6	3713	3718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
66	NC_020421	CAA	3	9	3736	3744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
67	NC_020421	CAA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
68	NC_020421	AGAGGC	2	12	3837	3848	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	189485777
69	NC_020421	TGA	2	6	3897	3902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485777
70	NC_020421	AT	3	6	3995	4000	50 %	50 %	0 %	0 %	189485777
71	NC_020421	ACC	3	9	4022	4030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485777
72	NC_020421	ACCT	2	8	4049	4056	25 %	25 %	0 %	50 %	189485777
73	NC_020421	AAC	2	6	4103	4108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
74	NC_020421	CAA	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
75	NC_020421	CAA	2	6	4144	4149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
76	NC_020421	CAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
77	NC_020421	CAA	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
78	NC_020421	ATT	2	6	4281	4286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485777
79	NC_020421	TA	3	6	4296	4301	50 %	50 %	0 %	0 %	189485777
80	NC_020421	A	7	7	4726	4732	100 %	0 %	0 %	0 %	189485778
81	NC_020421	TGT	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485778
82	NC_020421	ATG	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485778
83	NC_020421	TTCAAC	2	12	4821	4832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485778
84	NC_020421	CCTACT	2	12	4852	4863	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
85	NC_020421	CCTACT	2	12	4882	4893	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
86	NC_020421	CCTACT	2	12	4912	4923	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
87	NC_020421	CCTACT	2	12	4942	4953	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
88	NC_020421	CCTACT	2	12	4972	4983	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
89	NC_020421	CCTACT	2	12	5002	5013	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485778
90	NC_020421	GGATGA	2	12	5097	5108	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	189485778
91	NC_020421	TTA	2	6	5109	5114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485778
92	NC_020421	TGA	3	9	5148	5156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485778
93	NC_020421	TAG	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485778

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.